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近期，全国部分地方发生强降雨、台风、洪涝等自然灾害，出现畜禽因灾死亡情形。有关部门制定印发了多项技术指导意见，应对汛期动物疫病传播风险，强化畜禽产品安全。
洪涝灾害后，非洲猪瘟、高致病性禽流感等重大动物疫病和炭疽、血吸虫病等人畜共患病发生和传播风险增大。为切实做好洪涝灾区动物防疫工作，降低动物疫病发生和传播风险，农业农村部制定《洪涝灾区动物防疫技术指南（2023年版）》，该指南指出，蓄滞洪区内要及时打捞收集死亡畜禽、做好死亡畜禽无害化处理、全面开展养殖场环境消毒并控制媒介生物，蓄滞洪区外要对养殖场、屠宰场、交易市场、无害化处理厂等做好预防性消毒。同时，强化疫情监测预警、组织做好紧急免疫、加强畜禽饲养管理。
炭疽疫情与洪涝暴雨灾害的发生高度相关，汛期是炭疽高发期，雨水冲刷导致疫源地土壤中的炭疽芽孢杆菌暴露地表，汛期家畜抵抗力下降，容易受到病原侵袭，炭疽流行和发生风险增大。为切实做好炭疽防控工作，降低疫情传播风险，保障人民群众健康和公共卫生安全，中国动物疫病预防控制中心与中国疾病预防控制中心共同制定了《炭疽防控技术要点（第一版）》。该要点对人间和畜间的炭疽疫情监测排查、报告、处置等作出了详尽的指导，同时为消毒灭源、病死畜无害化处理、检疫监管、人员防护、健康教育、能力培训、联防联控等方面提供了操作性强的建议，为养殖等从业人员、基层动物防疫和疾控人员做好炭疽防控工作提供参考。
畜禽屠宰环节是保障肉品质量安全的重要关口，为避免洪涝灾后出现重大畜禽产品质量安全和公共卫生事件，农业农村部畜牧兽医局还印发了《汛期保障屠宰环节畜禽产品质量安全的指导意见》，提出加强入厂查验、强化检疫检验、落实清洗消毒、落实无害化处理、加强产品储运管理、强化监督执法并做好产销衔接。